b-Agarase

DF8006

100 U

268

制品说明

b-Agarase可以切断琼脂糖【α-L14-36-半乳糖酐-β-D13)半乳糖多聚体】生成琼脂寡糖。本制品是一种耐高温的琼脂糖酶,反应最适温度为60℃,适合于高温 (60℃) 下的琼脂糖降解反应。本制品适用于DNA片段的切胶回收,将含有DNA片段的琼脂糖凝胶切下后,在再熔解温度下再熔化琼脂糖胶,然后使用本制品降解琼脂糖,再经乙醇沉淀回收目的DNA片段。本制品特别适合于数十kbp以上的长片段DNA的切胶回收,且对DNA片段不产生损伤。

活性定义

1个活性单位的定义为:在60℃反应1小时的条件下,降解1%W/V)浓度的200 ml熔解后的低熔点琼脂糖生成可溶性琼脂寡糖所需的酶量。

纯度

8 U的本酶和1 mgl-Hind III片段在60℃下反应16小时,DNA的电泳谱带不发生变化。

8 U的本酶和1 mgSupercoiled pBR322 DNA60℃下反应16小时,DNA的电泳谱带不

发生变化。

2 U的本酶和1 mg16S23S rRNA37℃下反应3小时,RNA的电泳谱带不发生变化。

1 U5 U的本酶分别与1 mgl-Hind III 片段和1 mgl-Pst I 片段在37℃或60℃下反应

1小时后,再进行连接再切断实验,确认100% DNA片段能够连接,100%能被再切断,未检测出有3'5'核酸外切酶活性及磷酸酶活性。

用途

b-Agarase可以应用于DNA片段的琼脂糖凝胶回收实验。本制品降解琼脂糖后形成不能再成胶的碳水化合物分子,同时释放DNA片段。这些降解后产生的碳水化合物分子或b-Agarase通常不会影响限制酶酶切反应,DNA的连接转化等。b-Agarase特别适用于从凝胶中纯化大片段(>50 kbDNA,同时也可以用于小片段DNA的纯化。

Protocol

1. 进行琼脂糖凝胶电泳(使用低熔点琼脂糖效果更佳)。

2. 将含有目的DNA片段的凝胶切出,切成细块后移入已称重的Microtube中确认凝胶重量。

3. 加入1/10凝胶体积*10×b-Agarase Buffer平衡体系。

* 按凝胶重量1 mg=1 ml进行计算。

4.琼脂糖再熔化(具体再熔胶条件请参考各琼脂糖制品说明书,例如:LM-SIEVE Agarose

的再熔胶条件为65℃,10分钟),冷却至60℃后静置平衡5分钟。

5. 加入b-琼脂糖酶消化反应1小时,每200 mg(约200 ml)的1%凝胶中加入2 Ub-

Agarase

6. 冰中放置15分钟后,12,000 g离心15分钟。

7. 取出上清液(含DNA),加入盐溶液(盐终浓度:2.0 M CH3COONH40.15 M NaCl

0.3 M CH3COONa0.8 M LiCl)。

8. 加入1倍体积的异丙醇,充分混匀后-20℃冷却60分钟(或-80 20分钟)。

9. 12,000 g离心15分钟。

10. 除去上清,用70%的冷异丙醇清洗沉淀两次,真空干燥。

11. TE Buffer或其他合适的缓冲液溶解DNA沉淀。

从琼脂糖凝胶中回收DNA片段