服务特长

提供TaKaRaPerfect Real Time」系列产品最适合的Primer Set

为了使Real Time RT-PCR实验顺利进行,本公司对NCBI Data Base上登录的HumanMouseRatRefSeq的绝大部分mRNA序列(Human 20,000种,Mouse 16,000种,Rat 4,600),提供最佳的引物设计及合成服务。

省略研究者烦琐的引物设计操作

引物设计使用本公司独有的引物设计技巧和最新的RefSeq Data Base,同时运用各种生物信息网罗分析而选取的最佳引物。

省略反应条件优化操作

使用提供的引物,利用本公司的Real Time PCR试剂和推荐的标准反应条件,可以得到最佳的实验结果,无需进行Mg2+浓度和退火温度等反应条件优化实验。图1显示了使用TaKaRa设计的Primer SetHuman GAPDH)的反应例。

(免费提供引物、探针的设计服务,只收取引物、探针相应的合成费用)

1 反应例

cDNA的梯度稀释液(相当于从Human A431细胞株提取的总RNA 1 pg10 ng)为模板,Negative Control使用灭菌蒸馏水。使用TaKaRa设计的最佳Primer Set,通过Real Time RT-PCR良好地检测了Human GAPDH基因。图1中:上图显示的是扩增曲线,下图显示的是融解曲线。

本服务的引物设计条件*1具有如下特长:

最适合TaKaRaPerfect Real Time」系列产品使用。

不易形成引物二聚体。

通常引物设计在exon junction上,使genomic DNA的扩增难以进行*2

引物序列内不含有已知的SNP位点 (已在dbSNP上登录)*3

通过同源性检索确认了其特异性。

可根据实验目的,自主选择设计的区域。

通常一个目的基因提供13对引物*4:

①根据目的基因的全序列设计。

②在5'端开始的1,500 Base内设计。

③在3'端开始的1,500 Base内设计(用Oligo dT Primer进行反转录时使用)

*1 以下设计条件尽量同时满足,不能同时满足时,本公司将按各种条件的优先顺序进行选择。

*2 如果所研究的目的基因上没有exon junction,或者即使有exon junction,在exon junction上设计的引物不适合模板扩增,

此时引物也不在exon junction上设计。

*3 dbSNPNCBI提供的单碱基置换突变、短序列插入突变、短序列缺失突变的Data Basehttp//www.ncbi.nlm.gov/SNP/)

*4 有时以目的基因全序列设计的引物,恰好与以5'端序列或3'端序列设计的引物重叠,此时只能提供2对引物。有时目的基

因全序列短,5'端序列和3'端序列不能严格区分,此时只能以全序列为对象提供1对引物。

服务内容

(1) 制品内容

Primer(合成DNA)】

2支(Forward PrimerReverse Primer

形态:真空干燥品

合成量:保证2 OD以上

精制级别:PAGE级或高纯度级

【提供信息】

引物序列

GC含量

Tm

Target在目的基因上的位置及扩增片段大小

引物在基因组上的位置等。

(2) 基因数

NCBI Data Base上登录的HumanMouseRatRefSeq的绝大部分mRNA序列,SYBR Green I

嵌合荧光法检测用引物已设计完成的基因数:

Human 20,000(96%)

Mouse 16,000(95%)

Rat 4,600(94%)

(3) 服务要求

请认真填写Real Time PCR用引物设计合成服务委托单,委托单请在本商品目录F-39页上拷贝或在网上(http://www.takara.com.cn)下载获得。

委托单上需要提供的相关信息主要有:

①生物种(HumanMouseRat)

②目的基因信息(GenBank AccGene ID、关键词)

③引物设计的区域范围(全序列、5'端序列、3'端序列)

将上述信息发送至本公司的服务窗口。

(4) 价格·交货期

其他引物设计合成

服务

本公司同时承接HumanMouseRat以外的生物种以及对RefSeq之外的基因信息或客户独自拥有的序列进行引物设计合成服务。另外,还承接对采用TaqMan探针和Cycling探针法进行Real Time PCR所使用的引物、探针的设计合成等多种服务。

TaKaRa公司生产的双标记探针有很多种,常用的探针见下表。

此外,我们还可根据客户的特殊需要,生产特殊种类的双标记探针。详情请来电垂询。