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制品说明 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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本制品是采用SYBR(R) Green I 嵌合荧光法进行Real Time PCR的专用试剂。制品中已经将DNA聚合酶、反应用Buffer、dNTP、SYBR Green I 等试剂预混在一起,是一种2×浓度的Premix Type试剂,进行实验时,PCR反应液的配制十分方便简单。制品中的DNA聚合酶使用了改良后的Hot Start法用DNA聚合酶TaKaRa Ex Taq HS,与TaKaRa精心研制的Real Time PCR用Buffer组合使用,可以有效抑制非特异性的PCR扩增,大大提高PCR的扩增效率,进行高灵敏度的Real Time PCR扩增反应。 本制品适合于Thermal Cycler DiceTM Real Time System、ABI PRISM 7000/7700/7900HT、7300/7500 Real-Time PCR System、7500 Fast Real-Time PCR System、LightCycler(R)、 Line-Gene、Smart Cycler(R)、Mx3000P等各种机种的Real Time PCR扩增仪。试剂盒中还附带有ROX Reference Dye,可用于需要Dye的Real Time PCR扩增仪。此外,本制品也适用于使用玻璃毛细管的Real Time PCR扩增仪,并且不需要再添加BSA。本制品还适合于快速Real Time PCR的扩增反应。 本制品可以在宽广的定量区域内得到良好的标准曲线,对靶基因进行准确定量、检测,重复性好,可信度高。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
适用的Real Time PCR扩增仪 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Thermal Cycler DiceTM Real Time System (TaKaRa) ABI PRISM7000/7700/7900HT,7300/7500 Real-Time PCR System,7500 Fast Real-Time PCR System (Applied Biosystems) LightCycler(R)(Roche Diagnostics) Line-Gene(Bioer,杭州博日) Smart Cycler(R) System(Cepheid) Mx3000P (Stratagene) 其他各种Real Time PCR扩增仪 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Real Time PCR性能检测 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1. 使用Smart Cycler System Real Time PCR扩增仪,以lDNA为模板,进行300 bp DNA 片段的Real Time PCR扩增,通过SYBR Green I荧光信号的检测,确认具有良好及稳定的Real Time PCR扩增性能。 2. 55℃条件下反应10分钟,确认抗体对Ex Taq的活性抑制效率达90%以上。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
试剂盒原理 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
本制品使用了改良后的TaKaRa Ex Taq HS进行PCR扩增,通过检测反应液中SYBR Green I 的荧光强度,达到监控PCR产物扩增量的目的。 1. 本制品中的DNA聚合酶使用了改良后的TaKaRa Ex Taq HS,并结合TaKaRa独自开发的 Buffer系统,可以有效抑制非特异性PCR扩增,大大提高PCR扩增灵敏度。 2. 嵌合荧光检测法。 SYBR Green I与双链DNA结合后发出荧光,所以可以通过检测反应体系中的SYBR Green I 荧光强度,达到检测PCR产物扩增量的目的。 具体原理见下图。通过PCR反应生成双链DNA,SYBR Green I与双链DNA结合发出荧光, 通过检测荧光不但可以检测反应体系中的DNA扩增量,同时还能测定扩增产物的DNA融解温度。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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嵌合荧光法原理图 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
试剂盒特长 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
● 适用于Real Time PCR反应,可以快速正确地对目的基因进行检测、定量。 ● 在2×浓度的Premix中,预先混有SYBR Green I,PCR反应液配制时,只需加入模板、 引物、灭菌蒸馏水便可进行Real Time PCR反应,操作简单方便。 ● DNA聚合酶使用了改良后的TaKaRa Ex Taq HS,可以进行Hot Start法PCR反应,再与 TaKaRa公司独自开发的Buffer系统相结合,具有高扩增效率,高扩增灵敏度,高扩增特异性之特点。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Application | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Template Target 实验仪器 | :l DNA。梯度稀释制作标准曲线。 :检测l DNA的300 bp片段。 :Smart Cycler II System | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
实验例 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
操作方法 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1. 稀释lDNA。 将lDNA按10的倍数稀释成0.05 fg/ml~500 pg/ml 的8个梯度浓度。 2. 按下列组份配制PCR反应液(反应液配制请在冰上进行)。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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3. 进行Real Time PCR反应。 用离心机轻轻离心PCR反应管后放入Smart Cycler II System中进行Real Time PCR反应,进行Negative Control实验时的DNA模板使用了2 ml的灭菌蒸馏水,PCR反应条件如下: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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4. 分析Real Time PCR扩增曲线和融解曲线。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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5. 制作标准曲线。 反应结束后,由各扩增曲线得到的Ct值,制作标准曲线。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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6. 结果说明。 以lDNA为模板,可以检测到0.1 fg的lDNA。对融解曲线分析可知,DNA的扩增产物非常单一,由标准曲线可以看出,线性关系良好。因此我们可以得出结论,在实验浓度范围内,可以得到非常正确的PCR定量结果。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protocol | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
进行RT-PCR反应时,使用SYBR(R) PrimeScriptTM RT-PCR Kit(Perfect Real Time)(TaKaRa Code:DRR063A)更为方便。SYBR(R) PrimeScriptTM RT-PCR Kit由二部分组成,即:PrimeScriptTM RT reagent Kit(Perfect Real Time)(TaKaRa Code:DRR037A)和SYBR(R) Premix Ex TaqTM(Perfect Real Time) (TaKaRa Code:DRR041A,即本制品)。 这二部分试剂可以同时购买(TaKaRa Code:DRR063A),也可以单独购买。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
进行RT-PCR反应时的实验例 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
操作方法 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1. 按下列组份配制RT反应液(反应液请在冰上配制)。 使用TaKaRa Code:DRR037A的RT-Reagents试剂。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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*1 Random 6 mers和Oligo dT Primer同时使用,可有效地将全长mRNA反转录成cDNA。使用单引物 进行反转录时,使用量分别如下: Random 6 mers (100 mM) 0.5 ml (50 pmol) Oligo dT Primer (50 mM) 0.5 ml (25 pmol) Specific Primer (2 mM) 0.5 ml (1 pmol) *2 反应体积可按需求相应放大,10 ml的反应体系可最大使用500 ng的Total RNA。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
2. 反转录反应条件如下: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
*3 应用Specific Primer时,建议反转录反应条件设置为42℃ 15min。使用基因特异性下游引物进行 反转录时,有时会因错配而产生非特异性扩增。此时,将温度升到50℃会有所改善。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
3. 按下列组份配制PCR反应液(反应液请在冰上配制)。 (使用Smart Cycler System时) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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4. 将上述PCR反应液加入Real Time PCR用反应管中,然后再加入2 ml*4的RT反应液, 保证最终反应体积为25 ml。 *4 RT反应液的加入量不要超过Real Time PCR反应体积的1/10(V/V)量。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
5. 进行Real Time PCR反应,PCR反应条件如下: | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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6. Real Time PCR反应结果。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Target Template 扩增长度 | :Mouse GAPDH :Mouse Liver Total RNA经反转录反应后的cDNA溶液,其量相当于1 pg~ 100 ng的Total RNA量。Negative Control时的模板使用了灭菌蒸馏水。 :108 bp | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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7. 结果分析。 本实验检测到了Mouse Liver Total RNA 1 pg ~ 100 ng相当量的cDNA。分析融解曲线时,能够得到单一的PCR扩增产物。同时标准曲线的线性关系良好,在实验浓度范围内能够进行准确定量。 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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