DRR037S

10 ml反应×100

1,000

DRR037A

10 ml反应×200

1,800

制品说明

本制品是Real Time RT-PCR用的最佳反转录反应试剂。使用具有较强延伸能力的PrimeScript RTase可以在较短时间内高效合成Real Time PCRcDNA。操作简单,适合进行高通量分析。进行2 Step Real Time RT-PCR反应时,与SYBR(R) Premix Ex TaqTMPerfect Real Time)(TaKaRa Code: DRR041)或Premix Ex TaqTMPerfect Real Time)(TaKaRa Code: DRR039)配合使用,能进行高性能的基因表达分析。

特长

使用了具有较强延伸能力的PrimeScript RTase,可以在较短时间内高效合成Real Time PCRcDNA,是进行2 Step Real Time RT-PCR反应的最佳试剂。

含有Oligo dT PrimerRandom 6 mers两种反转录引物,可根据实际情况区别使用。反转录反应可以使用Random 6 mersOligo dT Primer,也可以Oligo dT PrimerRandom 6 mers同时使用。只扩增一种目的基因时,也可以使用Specific Primer作为反转录引物。

制品中附加了标准曲线制作用稀释液EASY Dilutionfor Real Time PCR),将Total RNAcDNA稀释至低浓度时也能够进行准确稀释,容易在宽广范围内获得准确定量的标准曲线。

试剂盒原理

本制品利用反转录酶PrimeScript RTaseRNA反转录成cDNA,然后使用Real Time PCR 反应用试剂,如:本公司的Premix Ex TaqTMPerfect Real Time) (TaKaRa Code: DRR039

SYBR(R) Premix Ex TaqTMPerfect Real Time) (TaKaRa Code: DRR041)等,以合成的cDNA为模板,进行Real Time PCR反应,其原理图见图1

Real Time PCR扩增反应可采用如图2显示的SYBR Green I嵌合荧光法或如图3显示的TaqMan探针法等。

1 2 Step RT-PCR法原理图

嵌合荧光检测法

SYBR Green I与双链DNA结合后发出荧光,实验时可以实时监测反应体系中的SYBR Green I荧光强度,达到检测PCR产物扩增量的目的。

具体原理见图2。通过PCR反应生成双链DNASYBR Green I与双链DNA结合发出荧光, 通过检测荧光不但可以检测反应体系中的DNA扩增量,同时还能测定扩增产物的DNA融解温度。

2 嵌合荧光法原理图

TaqMan(R)探针法

TaqMan探针法是使用5' 端带有荧光物质(如:FAM等),3' 端带有淬灭物质(如:TAMRA等)的TaqMan探针进行荧光检测的方法。当探针完整时,5' 端的荧光物质受到3' 端的淬灭物质的制约,不能发出荧光。而当TaqMan探针被分解后,5' 端的荧光物质便会游离出来,发出荧光。

PCR反应液中加入荧光探针后,在PCR反应的退火过程中,荧光探针便会和模板杂交。进一步在PCR反应的延伸过程中,Taq DNA聚合酶的5' 3' Exonuclease活性可以分解与模板杂交的荧光探针,游离荧光物质发出荧光。通过检测反应体系中的荧光强度,可以达到检测PCR产物扩增量的目的。具体原理见图3

3 TaqMan 探针法原理图

Application

本实验以Mouse Liver Total RNA为模板,使用2 Step Real Time RT-PCR方法,扩增Mouse GAPDH基因。实验时,首先以Mouse Liver Total RNA为模板进行反转录反应,然后将得到的cDNA溶液使用EASY Dilution10倍梯度稀释,再将相当于1 pg100 ng Total RNA量的cDNA作为模板,进行Real Time PCR扩增(使用了SYBR Green I嵌合荧光法), 制作标准曲线。具体实验过程如下:

【反转录反应】

Mouse Liver Total RNA为模板进行反转录反应。

1. 按下列组份配制RT反应液(反应液请在冰上配制)。

Real Time RT-PCR反应验证实验

*1 Random 6 mersOligo dT Primer同时使用,可有效地将全长mRNA反转录成cDNA

*2 反应体系可按需求相应放大,10 ml反应体系可最大使用500 ngTotal RNA

2. 反转录反应条件如下:

: Mouse Liver Total RNA经反转录反应后的cDNA溶液。

: Mouse GAPDH

使用EASY DilutioncDNA溶液按100101102103104105梯度稀释 (10倍梯度稀释)后,各取2 ml进行Real Time PCR反应。此时25 ml PCR反应液中的cDNA添加量分别相当于从100 ng10 ng1 ng100 pg10 pg

1 pgTotal RNA反转录得到的cDNA量。

Negative Control时的模板使用了灭菌蒸馏水。

: 108 bp

: Smart Cycler System

: SYBR Green I嵌合荧光法

3. 按下列组份配制PCR反应液(反应液请在冰上配制)。

使用SYBR(R) Premix Ex TaqTMPerfect Real Time)(TaKaRa CodeDRR041

4. 将上述PCR反应液加入Real Time PCR用反应管中,然后再加入2 ml的上述各cDNA

梯度稀释液。cDNA梯度稀释液的加入量不要超过Real Time PCR反应体积的1/10V/V )量。

5. 进行Real Time PCR反应,PCR反应条件如下:

6. Real Time PCR反应结果。

Real Time PCR扩增曲线图及融解曲线图如下:

反应结束后,根据扩增曲线的2nd derivative得到各扩增曲线的Ct值,制作标准曲线。

7. 结果分析。

本实验检测到了Mouse Liver Total RNA 1 pg100 ng相当量的cDNA。分析融解曲线可知,无论哪一种浓度的模板都能够得到单一的PCR扩增产物。同时标准曲线的线性关系良好,在实验浓度范围内能够进行准确定量。